| Sa | 04.04.09 - 13:30 | FC Sachsen Leipzig - SV Wilhelmshaven | 3:1 (1:0) |  |
| Sa | 04.04.09 - 13:30 | Hallescher FC - FC Oberneuland | 1:0 (1:0) |  |
| So | 05.04.09 - 14:00 | Hertha BSC II - Altona 93 | 4:3 (1:1) |  |
| So | 05.04.09 - 14:00 | VfL Wolfsburg II - FC Energie Cottbus II | 0:1 (0:0) |  |
| So | 05.04.09 - 14:00 | Hamburger SV II - Türkiyemspor 1978 | 0:0 (0:0) |  |
| So | 05.04.09 - 15:00 | Holstein Kiel - Hannover 96 II | 2:0 (0:0) |  |
| Sa | 11.04.09 - 13:30 | SV Babelsberg 03 - Chemnitzer FC | 3:1 (2:1) |  |
| Sa | 11.04.09 - 14:00 | FC Hansa Rostock II - VfB Lübeck | 1:1 (1:1) |  |
| So | 12.04.09 - 14:00 | VFC Plauen - 1. FC Magdeburg | 3:4 (2:3) |  |